Το νέο Τμήμα Εθνομουσικολογίας, το πρώτο πανεπιστημιακό τμήμα με το συγκεκριμένο αντικείμενο στην Ελλάδα, φιλοδοξεί να προσφέρει στους φοιτητές του ένα παράθυρο στον σύγχρονο μουσικό κόσμο μέσω της διαπολιτισμικής και διεπιστημονικής μελέτης ενός εύρους μουσικών πολιτισμών: απο τους παραδοσιακούς και γεωγραφικά προσδιορισμένους μέχρι τις ταχέως εξελισσόμενες παγκοσμιοποιημένες μουσικές τάσεις και μουσικές γλώσσες του 20ού και 21ου αιώνα.
Ο ακαδημαϊκός προσανατολισμός του νέου τμήματος είναι η ισορροπημένη μελέτη των μουσικών πολιτισμών τόσο απο την πλευρά της κοινωνιολογίας και της ανθρωπολογίας όσο και απο την πλευρά της εκτελεστικής πρακτικής της μουσικής. Ο προσανατολισμός αυτός συγκροτεί τη βάση του σχεδιαζόμενου προγράμματος σπουδών αλλά και του προσδιορισμού των προσόντων του διδακτικού προσωπικού που πρόκειται να επιλεγεί.
Το Τμήμα Εθνομουσικολογίας ιδρύθηκε την 01/10/2018 βάσει του Ν. 4559/2018 με έδρα το Ληξούρι της Κεφαλλονιάς ως νέο τμήμα της Σχολής Μουσικής και Οπτικοακουστικών Τεχνών του Ιονίου Πανεπιστημίου. Η σχολή περιλαμβάνει επίσης το Τμήμα Μουσικών Σπουδών και το Τμήμα Τεχνών Ήχου και Εικόνας. Το ακαδημαϊκό έργο του Τμήματος Εθνομουσικολογίας προβλέπεται να ξεκινήσει έως το ακαδημαϊκό έτος 2021-22.